有:PH值、加工過程、顏色、使用範圍、味道不同。天然可可粉是可可豆在加工的過程中不添加任何添加劑生產出來的淺棕色的可可粉,鹼化可可粉是可可豆指加工過程中添加臘食用鹼。
天然可可粉的顏色比鹼化可可粉淡一些,香氣也不如鹼化可可粉的濃郁,鹼化可可粉的使用範圍廣。
一般情況下,天然可可粉不用於液體產品的生產,不能直接用開水沖服,PH值一般在5.0~5.8之間。
鹼化可可粉可以用於任何食品的生產,也可以直接沖服,PH值一般在6.2~7.5之間。