始皇陵是一座充滿了神奇色彩的地下"王國"。那幽深的地宮更是謎團重重，千百年來引發了多少文人墨客的猜測與遐想。地宮是什麼樣的結構？地宮內藏匿了多少奇器珍寶？地宮內有沒有防盜機關？地宮挖了多深？始皇帝是銅棺石槨還是木棺木槨？始皇帝的屍骨是否完好無損？……這一系列的懸念無不困擾着專家學者。目前只能根據現有考古材料結合有關歷史文獻做初步的探討和推測。
謎團一：地宮深幾許？
據最新考古勘探資料表明：秦陵地宮東西實際長260米，南北實際長160米，總面積41600平方米。地宮規模相當於5個國際足球場，爲豎穴式。華裔物理學家丁肇中先生利用現代高科技與陳明等3位科學家研究推測秦陵地宮深度爲500至1500米。
現在看來這一推測近乎天方夜譚。假定地宮挖至1000米，它超過了陵墓位置與北側渭河之間的落差。那樣不僅地宮之水難以排出，甚至會造成渭河之水倒灌秦陵地宮的危險。根據最新鑽探資料，秦陵地宮坑口至底部實際深度約爲26米，至秦代地表最深約爲37米。但是否如此尚有賴於考古勘探進一步驗證。
謎團二：地宮設有幾道門？
秦陵地宮門道數量問題，其實《史記》中早有清楚的記載："大事畢，已藏，閉中羨，下外羨門，盡閉工匠藏，無復出者。"棺槨及隨葬品全部安置放在中門以內。工匠正在中門以內忙活，突然間"閉中羨門，下外羨門"。工匠"無復出者"。這裏涉及既有中羨門，又有外羨門，其中內羨門不言自明。地宮三道門似乎無可辯駁，三道羨門很可能在一條直線上。
謎團三："上具天文"作何解釋？
近年來，西安交大漢墓發現了類似於"天文""地理"的壁畫。上部是象徵天空的日、月、星象，下部則是代表山川的壁畫。由此推斷，秦陵地宮上部可能繪有更爲完整的二十八星宿圖，下部則是以水銀代表的山川地理。在這座有着象徵天、地的地下"王國"裏，秦始皇的靈魂照樣可以"仰觀天文，俯察地理"。
謎團四：地宮埋"水銀"之謎
始皇陵中究竟有沒有水銀始終是一個謎。現代科技的發展爲驗證秦陵地宮埋水銀這一千古懸案提供了必要的前題條件。地質學專家經過反覆測試，發現始皇陵封土土壤樣品中果然出現"汞異常"。相反其它地方的土壤樣品幾乎沒有汞含量。科學家由此得出初步結論：《史記》中關於始皇陵中埋藏大量汞的記載是可靠的。
謎團五：地宮珍寶知多少？
"奇器珍怪徙藏滿之"一語出自司馬遷筆下。《史記》明文記載的有"金雁"、"珠玉"、"翡翠"等。八十年代末考古工作者在地宮西側發掘出土了一組大型彩繪銅車馬。車馬造型之準確，裝飾之精美舉世罕見。
之前，考古工作者還發掘出土了一組木車馬，除車馬、御官俑爲木質外，其餘車馬飾件均爲金、銀、銅鑄造而成。地宮外側居然珍藏瞭如此之精美的隨葬品，那麼，地宮內隨葬品之豐富、藏品之精緻是可想而知的。
謎團六：使用棺槨是銅還是木？
《史記》、《漢書》均未明確記載。司馬遷只留下一句"下銅而致槨"的含糊記錄。於是有學者據此得出秦始皇使用的是銅棺。《史記》、《漢書》記載："冶銅錮其內，漆塗其外。""披以珠玉，飾以翡翠"，"棺槨之麗，不可勝原。"這裏"漆塗其外"、"飾以翡翠"的棺槨恐怕只能是木質的了。
如果是銅棺或石棺肯定用不着土漆塗其外，而只有木棺纔可能使用土漆。從先秦及西漢的棺槨制度考察，使用"黃腸題湊"的大型木槨是當時天子的特權。自命功勞大過三皇五帝的秦始皇不可能放棄"黃腸題湊"的木槨而改用其它棺槨。
謎團七：地宮有沒有空間？
目前考古勘探表明，秦陵地宮爲豎穴式。如果是豎穴木槨墓，墓室內外嚴嚴實實，不會再有空間。然而，陵墓主持者之一李斯則說："鑿之不入，燒之不燃，叩之空空，如下無狀。"李斯這段話如果記載無誤，那地宮明顯有個外殼。
按李斯所言可以推斷秦陵當是一座密封的、真空的大地堡式地宮。不然，怎麼會"叩之空空"？又怎麼會"燒之不燃"？由於考古勘探尚未深入到地宮的主要部位，所以地宮內部究竟是虛是實目前還是個謎。
謎團八：自動發射器
秦始皇在防止盜墓方面也苦費心機。《史記》記載：秦陵地宮"令匠作機弩矢，有所穿進者輒射之。"指的是這裏安裝着一套自動發射的暗弩。如果記載屬實的話乃是中國古代最早的自動防盜器。2200多年前的秦代何以生產如此高超的自動發射器也是一大謎。
謎團九：秦始皇遺體完好嗎？
20世紀七十年代中期長沙馬王堆漢墓"女屍"的發現震驚中外。其屍骨保存之完好舉世罕見。那麼，秦始皇的遺體也會保存完好嗎？如果單從遺體保護技術而言，秦代也應具備保護遺體的防腐技術。問題是秦始皇死在出巡途中，正值酷暑時節，經過50余天的長途顛簸，9月，屍骨運回咸陽，由死到下葬間隔近兩個月。根據當代遺體保護經驗，秦始皇遺體運回咸陽等不到處理恐怕早已面目全非了。據此推測秦始皇遺體保存完好的可能性很小。
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